在雌性孔雀鱼腹部凸起，且出现黑色胎斑时，可以给孔雀鱼配对了。这时，雄性孔雀鱼会将生殖器放对准雌性孔雀鱼生殖孔并不停的追逐，完成反复多次的射精。当雌性孔雀鱼受精后，腹部逐渐变大，胎斑也会扩大，这时就可以捞出单独饲养了。
孔雀鱼是卵胎生，孔雀鱼的交配是从雌性孔雀鱼三四月龄左右腹部凸起，出现黑色胎斑时发情开始，而同时雄性孔雀鱼会不停的追逐，试图同一时间与雌性孔雀鱼进行交配。
在雄性孔雀鱼准备交配时，会将生殖器一方对准雌性孔雀鱼的生殖孔，速度很快。由于雌性孔雀鱼卵子量较多，雄性孔雀鱼也需要反复多次进行射精完成交配。
而当雄性孔雀鱼在雌性孔雀鱼体内受精后，雌性孔雀鱼的腹部会逐渐变大，胎斑也会进一步扩大。这时就可以将雌性孔雀鱼从鱼缸中捞出，单独饲养在繁殖缸中等待繁殖。
