净水魔棒不是万能的，只能起到微效的杀菌、增氧、除藻，并不能取代鱼缸过滤。净水魔棒只能以电解鱼缸微生物和氧化型较强的物质为主，使用净水魔棒，可能还会使钙镁离子沉淀产生水垢，这时就需要停止使用净水魔棒。
养鱼使用的净水魔棒只能作为辅助工具使用，在杀菌、增氧和除藻方面有一定的用处，但是并不是万能的，不能完全依靠净水魔棒来净化水质，鱼缸过滤是不能被任何净化器给取代的。
鱼缸使用的水并不是纯水，而是含有阴阳离子物质，净水魔棒其实是一个电解器，只能在净水魔棒的作用下，电解微生物和氧化性较强的物质，并不能够使鱼缸水质变得清澈。
并且在使用净水魔棒后，魔棒上还会出现白色水垢，这主要是因为水中含有钙镁离子，经过静电引力作用产生沉淀。一旦发现使用净水魔棒出现水垢，则需要及时停止使用。
