让鳄龟自然配种就行，当鳄龟发情了可以把雌龟和雄龟养一起。一般鳄龟在发情时会出现浅游、追逐、异常活跃、攻击性增强等症状。注意在发情前期不要过早混养雌龟和雄龟，它们容易互相攻击，影响交配质量。
当鳄龟发情了，把雌龟和雄龟放在一起让它们自然交配就行。鳄龟发情时间一般在冬眠结束，体力恢复完整后，大概从每年4月开始，这时当水温达到二十度以上，鳄龟便会发情交配，交配季节一直持续到9～10月份。
鳄龟在发情时会有特征表现，雄龟会浅游，异常活跃，遇到雌龟会追逐，碰到雄龟会攻击撕咬。当雄龟追上母龟，会骑到母龟背上，抱住它的身体，咬住它的脖子，然后进行交配。
在鳄龟发情前期，不要过早将雌龟和雄龟放到一起，鳄龟的战斗力很强，容易攻击对方的脖子、头部、生殖器等部位，影响配种时的交配质量。
