荷兰猪和仓鼠之间在科目，体型，习性和认主方面都有较大的区别，仓鼠是仓鼠科鼠型亚目的，体型小，且不同个体之间体型差距大，有食囊，认主能力较差。而荷兰猪是豚鼠科豪猪亚目的，体型大，没有食囊，更加容易认主。
荷兰猪和仓鼠都是啮齿类小动物，但仓鼠是仓鼠科、鼠形亚目的，与老鼠是亲戚，而荷兰猪是豚鼠科、豪猪亚目的，与豪猪、龙猫算是亲戚。
体型方面上，荷兰猪会比仓鼠大很多，并且不同仓鼠之间也存在较大的体型差异，最大仓鼠体型是最小仓鼠的一倍以上。而荷兰猪无论怎么分类，它们的体型都差不多。
习性方面，仓鼠能将食物储藏进食囊里，而荷兰猪没有食囊，吃不完的食物它们会叼回窝里。饲养方面，荷兰猪可以分辨主人的声音，更加亲近主人。
