平行志愿采用“分数优先，遵循志愿，一轮投档”的投档原则。录取时，首先将达到批次录取最低控制分数线的考生，按考生成绩从高到低排序，由计算机对每个考生所填报的平行院校志愿，依次检索，并且只投档一次。
平行志愿录取规则
分数优先
在检索考生志愿前，首先要将所有考生分科类(文史类或理工类)按考生总分从高到低排序。投档检索时，先从最高分数考生所填报的五个院校志愿依次检索，再依次检索此后分数的考生志愿。除了高考状元，其他每名考生都得等待前一分的考生投档结束后才能开始有被投档的资格。
遵循志愿
考生所填报的五个院校志愿仍有逻辑顺序。检索考生所填报的五个院校志愿时，是按逻辑顺序即先左后右A、B、C、D、E院校依次进行的。当考生总分符合首先被检索到的A院校投档条件时，该生即被投到A院校。
一次性投档
即按各招生院校确定的投档比例，逐个检索完所有应被检索的考生志愿后，一次、同时、全部将符合条件考生电子档案投给各招生院校。考生档案一旦投出，即不再检索该考生的后续志愿，因此，对于考生来说只有一次投档机会。如果考生因五个平行志愿均未满足条件而未被投档，或投档后被院校退档，该考生只能参加征集志愿或下一批次录取，这一点是平行志愿中最应关注的因素之一。
平行志愿的好处
1、强化了分数的作用，大大减少了高分低就、高分落榜现象；与此低分考生侥幸高就的机会几乎没有了。
2、降低了院校录取数据的年度波动幅度，出现“大小年”现象的几率小了。
3、院校录取分数区间扁平化了，即最高录取分与最低录取分的差值小了。四是增加了考生第一志愿的录取概率，降低了志愿填报难度和报考风险。
4、降低填报志愿的风险，以前的填报志愿，考生只能选择一所高校作为第一志愿，选报志愿的难度和风险较大。实行平行志愿填报，考生可以同时填报多所高校，志愿选择的空间增大、风险降低。
