小绿毛龟以龟粮为主食，平时需要尽量多补充蛋白质，因此可以喂食蚯蚓、面包虫、小鱼虾、红虫、果蔬等，但是尽量不要喂食太多，以免小绿毛龟挑食，平时不能喂食肥肉，最好能喂食活体食物，保持饮食多样才能让小绿毛龟长得快。
绿毛龟食量很大，但是小绿毛龟尽量不要喂食太多，基本上以喂食龟粮为主，然后适当的喂食些荤食，例如蚯蚓、面包虫、小鱼虾、红虫等，不能单一喂食一种食物。
平时为了维持绿毛龟体内营养均衡，最好适当的喂食些新鲜的果蔬，也能防止小绿毛龟出现营养不良导致绿毛褪色的现象，但尽量不要过多喂食，以免小绿毛龟挑食。
若是喂食肉类，例如鸡肉、牛肉、猪肉等，需要注意不能喂食肥肉，必须要喂食瘦肉，并且在喂食活食的时候最好能喂食活体食物，才能是其中的高蛋白被小绿毛龟吸收。
