检察院不起诉是由本检察院检察长或者检察委员会决定的。根据国家相关规定，犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者有刑事诉讼法第十六条规定的情形，人民检察院应当作出不起诉决定。一般对于危害不大、情节显著轻微的，不是犯罪的不起诉；经特赦令免除刑罚的不起诉；犯罪嫌疑人、被告人死亡的不起诉。
法律依据：《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百七十七条犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者有本法第十六条规定的情形之一的，人民检察院应当作出不起诉决定。对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。
