孔雀鱼分开养是为了防止因为咬尾导致尾巴溃烂，也是为了繁殖培育出纯良的孔雀鱼仔。当饲主不愿意饲养过多的孔雀鱼时，也会通过分开饲养来防止繁殖。将孕期的孔雀鱼分开饲养，是为了防止其它孔雀鱼碰撞，出现难产的情况。
孔雀鱼混养容易出现咬尾的情况，若是情况严重的话，还会导致孔雀鱼患上烂尾病，导致尾巴溃烂。若是将孔雀鱼不同种类混养，还会出现繁殖混乱的现象。
因此，为了培育出纯良的孔雀鱼，最好将孔雀鱼进行同缸隔离饲养。若是不想繁殖过多孔雀鱼，也可以将同种多尾雌雄孔雀鱼分开饲养。
若是怀孕将孔雀鱼分开养，则是为了避免与其他孔雀鱼发生触碰，以免发生难产的现象。这时，需要将临产期的孔雀鱼单独饲养在加氧的繁殖缸内，单独喂食。
