毕业生主要就业方向为管理机构、国家机关、医疗机构、国际制药、保健品企业等，主要目的地为科研机构、医院影像、设备、临床工程、信息中心等相关部门、医疗器械相关企事业单位、，以及相关政府管理部门。
生物医学工程是应用最先进的科学和工程理论和方法研究人类生命现象和规律的学科。因此，其研究领域极为广泛，研究方向也非常多。在每个方向上，它都有非常广泛的内容。因此，生物医学工程领域也是未来几十年最容易出现理论突破和技术创新的学科领域之一。
现代医学技术的进步离不开生物医学工程的发展，这表明生物医学工程具有广阔的就业前景。
生物医学工程专业可以说是一个灵丹妙药专业，而本科学习只是一个基础。如果你想继续深造或暂时有一个严峻的就业前景，你可以选择参加研究生入学考试。每所学校的侧重点不同，研究生入学考试的科目可能会发生变化。
生物医学工程的就业导向生物医学工程专业毕业生可与管理机构和国家机关、医疗机构（临床研究、高度专业化医疗护理、管理）、研究所、大学（基础研究、教学）、国际制药和保健品企业（管理、研发）合作，私人机构和医生使用、销售和服务医疗器械。
毕业生可以直接参与高度专业化的医学护理工作，解决临床基础研究问题。他们开发的仪器和系统在观察、诊断、治疗和缓解疾病方面发挥着非常重要的作用。
